月经性癫痫所用药物与大发作相似，首选克痫胶囊（丸）、全蝎珍珠丸，也可选用丙戊酸类、巴比妥类、苯妥英钠、卡马西平治疗。因本型癫痫在发作时相上有其特点，故在药物的使用方法上与其它各型癫痫不同。
对于仅在月经期发作，而其它时间1次也不发作的癫痫，可在每次月经来潮之前数日开始服用抗痫剂，月经过后渐停药，平时可不服用。
平时也有发作，而月经期发作明显增多，难以控制的病例，经常服用常规量抗痫剂，月经期可将抗痫药量增加1/4～1/3，月经过后再恢复常规量。或经常服用常规量的抗痫剂，每次月经来潮时加服醋氮酰胺250毫克，每日3次，月经过后停服。