男性更年期综合征是一组多症状的症候群，当出现类似症状时，决不可轻易下结论说，这是男性“更年期综合征”的表现。因为男性更年期又是躯体各脏器容易发生器质性病变的时期，如脑动脉硬化症、高血压病、神经衰弱、抑郁症、严重的慢性贫血、胃肠道的恶性肿瘤等。这些疾病也有类似男性更年期综合征的症状，若不仔细的诊断，盲目下结论，就有可能耽误和隐蔽其他疾病的诊断和治疗。

为明确诊断，可以测定血清睾酮水平，如果血清睾酮显著低于正常指标就可能是更年期综合征。也可以做试验性治疗，方法是使用丙酸睾丸酮50 毫克，肌肉注射，隔日一次，治疗2个月，症状如得到缓解，即可诊断为男性更年期综合征；如果睾酮水平不低，或者有一系列典型症状伴有睾酮降低，虽经激素治疗，但无显著效果，那么，首先应排除其他疾病后，方可诊断为男性更年期综合征。

睾丸活检有一定参考价值，可观察睾丸的生精能力，睾丸间质细胞的形态结构，以判断睾丸变性退化的程度。但是，睾丸活检是创伤性检查, 故不提倡做睾丸活检。