1.咽炎。特别是链球菌性咽炎，发热和咽部痛，但传染性单核细胞增多症除了上述症状外，尚有淋巴结肿大、皮疹、周围血中出现非典型淋巴细胞、血清嗜异性抗体反应阳性等。
2.肝脏疾病。本病约1/3患者有肝肿大，有一小部分可出黄疸，伴有肝脏酶谱升高，故应与肝脏疾病相鉴别，而本病尚有淋巴结肿大，特异性的抗体阳性等表现。