1.对艾滋病认识不足。多数医院尚未接诊过艾滋病患者，许多医务人员对该病只是从书本杂志中了解，并没有诊治经验，故容易误诊或漏诊。如早期临床表现与流感、单核细胞增多症相似，则易误诊为该两种疾病。如：有一患者反复发热，咳嗽约半年，近10天加重且气急，多家医院据此诊断为“支气管炎”。后经一家医院纤支镜肺活检，发现艾滋病毒抗体阳性才诊断为本病。
2.未采集到流行病学资料。病人未向医生提供或故意隐瞒性乱史，医生无法了解和掌握本病的流行特点。