尿路感染的诊断不能单纯依靠临床症状和体征，而要依靠实验室检查。诊断还要明确致病菌、感染部位、肾功能状态及有无诱因，同时还应除外其他类似疾病，凡是有真性细菌尿者才能确定为尿路感染。尿路感染诊断成立后，还要进一步明确是上尿路感染还是下尿路感染，上下尿路感染的预后及治疗方案均不同，相互区别是十分必要的。一般上尿路感染除尿路刺激症状外常伴有发热，腰痛和肾区叩击痛，但单靠此判断并不可靠，应进一步行泌尿系B型超声检查、肾功能，尿细菌培养、肾图等检查，必要时可行静脉肾盂造影，这些检查除能帮助明确诊断外，还可帮助找到尿路感染易发因素，如梗阻、尿路畸形等。具体诊断依据如下：

1.尿路感染。①正规清洁中段尿（要求停留在膀胱中4～6小时以上）细菌培养，菌落数≥10⁵/毫升。②清洁离心中段尿沉渣白细胞数超过10个/高倍视野，或有尿路感染症状者。③膀胱穿刺尿培养，如细菌阳性（不论菌数多少），亦可确诊。④作尿液细菌培养计数有困难者，可用治疗前清晨清洁中段尿（尿停留于膀胱4～6小时以上），正规方法的离心尿沉渣革兰染色找细菌，如细菌超过1个/油镜视野，结合临床尿路感染症状，亦可确诊。⑤尿细菌数在（10⁴～10⁵）/毫升之间者，应复查；如仍为（10⁴～10⁵）/毫升，需结合临床表现进行诊断或作膀胱穿刺尿培养确诊。具备上述1、2条就可以确诊。如无第2条表现则应再作尿细菌计数复查，如仍≥10⁵/毫升，且两次为同种细菌者，可以确诊。

2.上、下尿路感染的鉴别。具备上述尿路感染标准兼有下列情况者：①尿抗体包裹细菌检查，阳性者多为肾盂肾炎；阴性者多为膀胱炎。②膀胱经灭菌处理后的尿标本细菌培养结果阳性者为肾盂肾炎；阴性者多为膀胱炎。③临床症状：有发热（38℃以上）或腰痛、肾区叩痛、压痛或尿中白细胞管型者，多为肾盂肾炎。④经治疗后症状已消失，但又复发者多为肾盂肾炎（多在停药后6周内）；用单剂量抗菌药治疗无效或复发者多为肾盂肾炎。⑤经治疗后仍留有肾功能不全表现，能排除其他原因所致者；或Ｘ线肾盂造影有异常改变者为肾盂肾炎。

3.急、慢性肾盂肾炎的鉴别。①尿路感染病史在1年以上，经抗菌治疗效果不佳，多次尿培养细菌定量虽有增减但均阳性或频繁复发者，多为慢性肾盂肾炎。②经治疗症状消失后，仍有肾小管功能（尿浓缩功能等）减退，能排除其他原因所致者，为慢性肾盂肾炎。③X线造影证实有肾盂肾盏变形，肾影不规则甚至缩小者为慢性肾盂肾炎。

4.尿道综合征（尿频－排尿困难综合征）。应具备以下3项：①女性患者有明显的排尿困难、尿频，但无发热，血白细胞增高等全身症状。②多次尿细菌培养菌落数小于10⁵/毫升。③尿中白、红细胞增加不明显（少于10个/高倍视野）。

5.尿路感染复发。应具备下列两项：①经治疗症状消失、尿细菌培养阴转后在6周内症状再现。②尿细菌数≥10⁵/毫升，而菌种与上次相同（菌种相同而且为同一血清型，或者药敏谱相同）者。

6.重新发生的尿路感染（再感染）。应具备下列两项：①经治疗后症状消失，尿菌阴转后，症状再现（多在停药6周后）。②尿菌落数≥10⁵/毫升，但菌种（株）与上次不同者。