发生憩室的基本病因是十二指肠壁上的局限性薄弱或缺陷，可能为先天性的肌层发育不全，或与十二指肠的局部解剖有关。在胆管、胰管通过处的十二指肠壁容易有缺陷，且十二指肠上方有幽门，下方有空肠曲，故其内压比其他部位高，内压持续或反复升高，则肠壁薄弱区向外膨出就易产生内压性憩室；或者肠壁外有粘连牵拉，均可导致憩室的发生。

    憩室内壁多系肠上皮细胞，并可有异位胰、胃和其他腺体组织。按形成憩室的不同原因和部位，可将十二指肠憩室分为四类：①先天性憩室，比较少见，为先天发育异常；②原发性憩室，又称后天性憩室，十二指肠局部有先天性解剖缺陷，使肠壁的粘膜或粘膜下层组织向外突出形成；③继发性憩室，大多数是因胃、十二指肠溃疡或胆囊炎所形成的疤痕牵引部分十二指肠壁而产生的，故又称假性憩室，多数位于十二指肠球部；④壶腹部憩室，在壶腹部形成憩室，胆总管及胰腺管开口于憩室之底部，该处也是十二指肠壁的薄弱处。十二指肠憩室可大可小，如与肠腔连接的入口处（憩室颈）较狭窄时，则进入憩室内的食物不易排出，导致潴留，继发炎症、溃疡、出血、穿孔等并发症。