气管肿瘤容易与支气管哮喘、喘息型支气管炎、慢性支气管炎急性发作等常见疾病混淆，故诊断中需要仔细鉴别。这些支气管疾病主要表现为呼气性呼吸困难，给予糖类皮质激素、支气管扩张剂、抗生素等治疗有效。而气管肿瘤则表现为吸气性呼吸困难，且呈进行性加重，与体位变化有关，激素与支气管扩张剂治疗无明显效果。有经验的医生据此即可初步作出鉴别诊断，进一步做纤维支气管镜、痰脱落细胞学检查及CT、X线断层片等相关检查，便可确诊。

1.支气管哮喘。此病是一种慢性气道炎症，引起易患人群的气道广泛狭窄，以及可逆转的气道阻塞症状，如喘息、呼吸困难等，可自然缓解，或经抗炎药、糖皮质激素、支气管扩张剂等治疗而缓解。而气管肿瘤为占位性病变所致气管狭窄，未经抗肿瘤治疗（放、化疗或手术），阻塞症状进行性加重且不可逆转。

2.喘息型支气管炎。此病为慢性支气管炎的一个临床类型，即慢性支气管炎的患者，具有喘息症状，并经常出现哮鸣音，也正是后者易与气管肿瘤相混淆。但气管肿瘤的哮鸣、喘息与体征有关，且呼吸困难是吸气性的，用抗生素与激素平喘药治疗无效等可资鉴别。

3.慢性支气管炎急性发作期。此诊断是根据病程经过而分的，即指慢性支气管炎在1周内出现了脓性或粘液脓性痰，痰量明显增加，或伴有发热等炎症表现，或1周内喘、咳、痰任何一项症状明显加剧者。当一名慢性支气管炎病人同时患了气管肿瘤，出现咳嗽、呼吸困难、哮喘，临床医生就易漏诊后者，以为是慢性支气管炎急性发作。此时，除了气管肿瘤的局限性哮鸣音、吸气性呼吸困难等典型症状外，痰脱落细胞学、纤维支气管镜、气管断层摄片等检查可明确诊断。