菌痢的潜伏期为1～7日，大多为1～2日。它的肠道病变以乙状结肠、直肠最显著，严重时可波及整段结肠及末端回肠。急性菌痢肠粘膜呈弥漫性充血、水肿，散在点状出血及粘膜坏死，其表面常有粘液、纤维素及脓性渗出物，形成弥漫性浅表性溃疡。慢性菌痢肠壁增厚，偶见肠腔狭窄及息肉形成。中毒型菌痢的肠道病变常不明显，仅有肠粘膜轻度充血、水肿，重者可见肠道外病变，如脑组织水肿、细胞浸润和点状出血等。临床上分急性细菌痢疾和慢性细菌性痢疾两型。

　　1.急性细菌性痢疾。

　　①普通型。起病急，畏寒、发热、体温高达39℃；腹泻每日10～20次或更多，大便初为水样或黄色糊状，后转为粘液脓血便；病人常自觉脐周或左下腹部有阵发性疼痛，严重者可发生脱水和代谢性酸中毒。医生检查病人左下腹部常有压痛，肠鸣音亢进。小儿急性菌痢随体温升高，可出现精神萎靡、嗜睡和烦躁，甚至惊厥。排便前可因腹痛而哭闹不安。

　　②轻型。全身症状轻，无明显发热。肠道症状不典型，腹泻每日3～5次，大便为黄色糊状或水样，带有少量粘冻；腹痛、里急后重轻或无，容易误诊。若治疗不及时或不彻底，易转变为慢性。

　　③中毒型。多见于2～7岁胖儿童。起病急，发展快。主要表现为高热、惊厥。发病初期胃肠道症状多不明显，可迅速出现周围循环衰竭症状以及呼吸衰竭症状。如面色青灰、四肢厥冷、紫绀、心率加快、脉博细速血压下降尿少或无尿，反复持续惊厥，意识障碍、瞳孔大小不等，对光反射迟钝或消失，呼吸不匀，甚至呼吸暂停等。成人中毒型菌痢较少见，常见于年老体弱及慢性疾患者，肠道症状明显，以脱水、代谢性酸中毒和感染性休克等为突出表现。中毒型菌痢在临床上具体又分脑水肿型、休克型、肺型以及混合型四型。各型特点以某系统或某器官症状为突出表现，易误诊，需谨慎与其他疾病加以区别。

　　2.慢性细菌性痢疾。凡菌痢病程超过2个月者称为慢性菌痢，临床上可分为急性发作型、慢性迁延型和慢性隐匿型3种：

　　①急性发作型。病前6个月内有菌痢病史，每当受凉，饮食不当、劳累或精神紧张就会出现急性菌痢症状，此次发作有急性症状（腹痛、腹泻、里急后重、粘液或脓血便），但全身中毒症状较轻。需排除再感染者。

　　②慢性迁延型。最为多见。急性菌痢后常有轻重不一的痢疾病状。大便时干时稀或长期腹泻，带有粘液脓血。腹部可有压痛。病程较久者可有消瘦、贫血、维生素缺乏、营养不良、劳动力减退等表现，临床症状时好时发。

　　③慢性隐匿型。为最少见的一型，有过去痢疾病史，临床症状不明显，却存在肠道病变，间歇排菌。

　　3.并发症。菌痢在恢复期或急性期偶可并发多发性渗出性大关节炎。中毒型痢疾可并发痢疾杆菌败血症、弥漫性血管内凝血、中毒性心肌炎。慢性菌痢可并发营养不良、贫血和各种维生素缺乏症。孕妇患重症菌痢者可致早产或流产。小儿急性菌痢可并发脱肛、鹅口疮及口角炎等。