更年期的最早变化是卵巢功能衰退，然后才表现为下丘脑和脑垂体功能的退化。

1.内分泌因素的影响：卵巢功能减退，血中雌激素、孕激素水平降低，使正常的下丘脑-垂体-卵巢轴之间平衡失调，影响了植物神经中枢及其支配下的各脏器功能，从而出现一系列植物神经功能失调的症状。有实验证明，在切除卵巢或放射治疗（简称放疗）后雌激素水平下降，也会出现植物神经功能失调的症状，而补充雌激素后其症状可以得以改善。

2.神经递质的影响：更年期妇女血中β-内啡肽及其自身抗体含量明显降低，引起神经内分泌调节功能紊乱。神经递质5-羟色胺水平异常，这与患者的情绪变化密切相关。

3.其他因素的影响：每个人的人格特征、神经类型以及职业、文化水平均与更年期综合征的发病及症状严重程度有关。大量临床实践证明，患更年期综合征的病人多数神经类型不稳定，且有精神压抑和神经受过较强烈刺激的病史，而性格开朗、神经类型稳定及经常从事体力劳动的人很少发生更年期综合征，即使发生了则其症状也较轻、消退也比较快，这说明该病的发生可能与高级神经活动有关。