1.淋菌性尿道炎。非淋菌性尿道炎最易与淋菌性尿道炎相互误诊，但如果思想上提高警惕，认真查体和做一些针对性的实验室检查就可能减少误诊。两病可从以下几方面鉴别。

2.细菌性阴道病。本病是由加特纳菌和一些厌氧菌增多、乳酸杆菌减少、阴道的生态系统改变而引起的疾病。发病与性关系混乱有一定的关系。临床上主要以四方面的改变为特点：①分泌物增多，呈面糊样粘稠，可伴有许多气泡；②酸碱度增高，Ph值达7～7.5，并伴有鱼腥样臭味；③分泌物中可找到线索细胞，这是一种上皮细胞，表面附有大量加特菌，因而外观呈点彩状；④分泌物涂片可找到线索细胞和革兰染色阴性球杆菌。可选用甲硝唑、氯洁霉素、乳酸制剂等治疗。

    3.尿道、眼、滑膜综合征（又称瑞特综合征）。本病的发生与性关系混乱有关，90%以上发生在青年男性。临床上有尿道炎表现,并出现以负重关节为主的关节红肿、疼痛和活动受限,同时伴有眼结膜水肿、充血及有脓性分泌物、眼睑肿胀等，还可有皮肤、粘膜、血管系统的病变。治疗本病除适当休息外，应用水杨酸、保泰松等药对缓解关节疼痛有较好的疗效。