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为了避免或减少非淋菌性尿道炎的误诊或漏诊，在临床工作中着重强调以下几个方面。一是提高对本病的警惕性，遇到尿道烧灼、刺痒、有少量薄的粘液性分泌物和排尿不适时要想到本病的可能性。二是强调全面详细询问病史，要以认真负责的态度,善意详细地询问有关患病的过程，特别是有无性关系混乱史和配偶的健康情况等。三是要进行认真细致的体格检查，特别是外生殖器的检查，观察有无红肿及分泌物的情况,检查睾丸有无压痛等，四是重视实验室检查，衣原体的检测方法包括衣原体细胞培养、细胞学检查、酶免疫检查和聚合酶链反应检测等。支原体的检测包括支原体培养、血清学试验、生物学方法等。
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