由于该病在我国以散发病例为主，且在长江以南较少发病，应属罕见病，加上发病早期仅有发热及其他非特异性症状，全身中毒症状不明显，因此容易误诊，若患者出现如下表现，应注意黑热病的可能：①复发与间歇交替出现的，进而发展为不规则发热、乏力、消瘦、贫血貌等；②肝、脾、淋巴结肿大，尤以脾肿大为甚；③全血细胞减少；④血培养、肥达氏反应、胸片、血片找疟原虫等检查未能明确发病的原因者。若符合以下条件者应可诊断为黑热病：①进一步检查，取骨髓或肿大的淋巴结穿刺液作涂片染色（姬氏或瑞氏染色）找无鞭毛体，以及骨髓培养（NNN培养基）阳性，可基本明确为黑热病。②采用单克隆抗体检测患者循环抗原有辅助诊断价值。另外，流行病学资料也很重要，是诊断该病重要的线索，医生应询问病人在5～9月间有无流行区居住史，被白蛉叮咬史，或输血史等，以协助诊断。