在原有疾病（如急性肠道、胆道感染等）的基础上，突然发生寒战、高热、肝区疼痛、肝脏肿大，且有肝区触痛及叩击痛等体征，即应想到有细菌性肝脓肿的可能，应做进一步详细检查。其诊断依据除根据临床表现外，还要结合下列辅助检查：

    1.B型超声。因其快捷、准确、有效、无损伤性，可作为肝脓肿的首选检查方法。它最能区别肝实质肿物与肝脓肿。能分辨肝内2厘米的脓肿病灶，并且可以测定脓肿部位、大小及距体表深度，为确定脓肿穿刺点或手术引流进路提供方便，其阳性诊断率可达95% 以上；但应注意，对小于2厘米的脓肿，尤其是1厘米左右的多发性肝脓肿难以肯定；对肝癌坏死液化，B型超声本身亦难以区别是癌组织坏死液化，还是肝脓肿；另外，尚处于炎症浸润阶段的肝内感染，有大量坏死组织未完全液化，或脓汁粘稠时亦显不出液平段或液性暗区。因此，肝脓肿的诊断有时不能完全依赖B型超声检查。

    2.X线检查：X线可见肝脏阴影增大，右膈肌抬高和活动受限；位于肝脏膈面的大脓肿可见到膈肌局限性隆起，并伴有右下肺受压、肺不张、胸膜反应或胸腔积液等。随着CT的普及，X线透视已不是主要检查手段，CT亦有定位诊断能力，尤其是对多发性小脓肿的诊断帮助较大，但对不典型的肝脓肿，CT诊断也有误诊的现象，主要误诊对象为肝癌。

    3.诊断性穿刺。是在肝区压痛最明显处或超声检查定位引导下，经皮施行诊断性穿刺，抽出脓液即可证实肝脓肿，经过对脓液检查可确定具体致病微生物，通过药敏试验，可选择有效的抗菌药物。

    4.实验室检查。细菌性肝脓肿的病人在寒战、高热期，白细胞总数较高，中性在90% 以上，有核左移及中毒颗粒，肝功可轻度异常（血清谷丙转氨酶，碱性磷酸酶升高等）。如继发胆管阻塞、黄疸指数明显增高。

    其他还有同位素扫描，肝脏血管造影，前者对较大脓肿的定位有一定诊断价值，后者主要是动脉相显示低密度区。