各种原因引起的蛋白质缺乏常与热能不足同时存在，都会影响细胞免疫和体液免疫功能。这种情况多发生于婴幼儿，常见于断奶后长期食用高糖低蛋白饮食的婴幼儿。患者可以出现胸腺萎缩或退化、胸腺细胞减少、胸腺激素活性降低、血中CD3和CD4 T细胞亚群减少、胸腺依赖性末成熟T细胞比例增大。对T细胞依赖性抗原的抗体反应低下，血中吞噬细胞的吞噬能力下降，多形核白细胞活性降低等。临床表现有体重降低、肌肉萎缩、浮肿、毛发稀少、腹胀、腹泻等。